这座学园都市地处东京西部占据了整整1/3的面积，却蕴藏着超过230万的人口。这里八成以上都是学生，他们身怀异能，掌握着超前科技。她们中的佼佼者，超能力水平高达Level5的御坂美琴（佐藤利奈配音），时常和她的好朋友初春饰利（丰崎爱生配音）、白井黑子（新井里美配音）相处，过着平凡而又充满复杂的日子。阴谋潜藏在这个世界的每一个角落，美琴和她的伙伴们不断奋战，试图揭露真相。某日，她们调查一宗卡事件时邂逅了长点上机学园的布束砥信（叶山郁美配音），发现了一项名为“量产型能力者计划”的恐怖计划。随着不安定的局势滋生，城市里的气氛愈来愈紧张……本片是由镰池和马（原作）和冬川基（作画）的原作《魔法禁书目录》的外传漫画第二季TV动画。这里只有无穷的想象和无尽的可能性，一切都会在这个号称最先进的学园都市里展开！g